NeatScript 1st Strand cDNA Synthesis Kit(P383)
稳定可靠的cDNA第一链合成试剂盒
- 货号/规格
产品说明
NeatScript Reverse Transcriptase是一种经过基因工程改造的M-MLV(Moloney Murine Leukemia Virus)反转录酶,缺失了RNase H活性,保留了完整的聚合酶活性,具有极好的延伸能力,能够有效克服RNA复杂的二级结构对反转录的影响,不需要高温打开RNA二级结构进行反转录,在42℃条件下就能得到很好的反应效果,因此,非常适合用于cDNA第一链合成、cDNA文库构建等。
NeatScript 1st Strand cDNA Synthesis Kit含有合成cDNA第一链所需要的全部组分,是合成高质量cDNA第一链的理想产品。
产品组分
组分 | P383S | P383M |
NeatScript Reverse Transcriptase (200 U/μL) | 50 μL*1 | 200 μL*1 |
5X NeatScript RT Buffer | 1 mL*1 | 1 mL*4 |
RNase Inhibitor (40 U/μl) | 25 μL*1 | 100 μL*1 |
dNTP Mix (10 mM each) | 50 μL*1 | 200 μL*1 |
Oligo dT Primer (50 μM) | 50 μL*1 | 200 μL*1 |
Random Hexamers (50 μM) | 100 μL*1 | 400 μL*1 |
DNase/RNase free dH2O | 1 mL*1 | 1 mL*4 |
储存条件
-20℃保存。
实验流程(cDNA第一链合成)
1.参考下表,在RNase-free Microtube管中配置混合液:
试剂 | 使用量/μL |
Template RNA | Total RNA≤5 μg, mRNA≤1μg |
Oligo (dT)18 Primer (50 μM) [1] | 1 |
dNTP Mix (10 mM each) | 1 |
RNase free ddH2O | Up to 10 |
[1] 也可以使用Random Hexamers (50 μM)或基因特异性引物GSP(2 μM)。
2. 65℃保温5分钟后迅速冰浴2~4分钟;
3. 短暂快速离心收集变性溶液于管底;
4. 在上述 Microtube 管中配制下列反转录反应液。
试剂 | 使用量/μL |
上述变性溶液 | 10 |
5X NeatScript RT Buffer | 4 |
RNase Inhibitor (40 U/μL) | 0.5 |
NeatScript Reverse Transcriptase (200U/μL) | 0.5~1 [1] |
RNase free ddH2O | Up to 20 |
[1]cDNA用于RT-PCR或cDNA克隆,推荐使用0.5 μL NeatScript Reverse Transcriptase; cDNA用于定量分析,例如定量PCR,推荐使用1 μL NeatScript Reverse Transcriptase。
5. 轻轻混匀;
6.如果以Random Hexamers进行反转录,须先30℃孵育10分钟,然后再42℃保温60分钟。
如果以Oligo (dT)18或GSP进行反转录,将上述反应液于42℃ [1]保温30-60分钟 [2]。
[1] 本产品具有极好的延伸能力,能够有效克服RNA复杂的二级结构对反转录的影响,但是如果使用GSP反转录发生引物错配,可以将反转录温度提高到50℃。
[2] 多数情况下30分钟即可,但如果目的片段较长,推荐延长时间至60分钟。
7. 70℃反应15分钟后冰浴冷却即得到cDNA溶液。
注意事项
1. 以Random Hexamers进行反转录,Random Hexamers在42℃条件下与模板RNA结合效率较低,因此须先30℃孵育10分钟,让Random Hexamers充分与模板结合并开始延伸,然后再42℃保温60分钟保证cDNA得到充分延伸。
2. 实验过程防止RNase污染:请保持实验区情节;实验操作穿戴干净的手套、口罩;实验所用的离心管、吸头等实验耗材均需保证RNase-free。
FAQs
Q1:本产品可以用原核生物RNA作为反转录模板吗?
A1:可以。
原核生物RNA没有polyA尾,不能使用Oligo (dT)进行反转录,需要使用Random Primers作为反转录引物。
Q2:延长反转录时间能否提高反转录效率?
A2:对于大多数基因,延长反转录时间不会显著提高反转录效率;对于部分GC含量较高或含高级结构的模板,适当延长反转录时间可提高反转录效率。
Q3:如何评判RNA质量?
A3:可从两个方面评价RNA质量:
(1) RNA完整度。通过琼脂糖凝胶电泳检测RNA完整度。以真核生物为例,完整的总RNA有清晰的三条带,分子量从大到小分别为28S、18S、5S,并且28S是18S亮度的两倍;若能看见三条带,但带型模糊或弥散,则说明RNA有部分降解,此时请立即进行反转录反应,并适量加大模板量;若只能看见分子量很小的一条带或没有条带,则RNA已完全降解,需要重新提取。
(2) RNA纯度。RNA纯度可以通过OD260/280和OD260/230两个比值是否在1.8~2.1范围内进行判断,蛋白、有机物、盐离子等污染会导致比值降低。
Q4:如何从Oligo (dT)、Random Primers、GSP(基因特异性引物)中选择反转录引物?
A4:需要依据具体的实验情况进行选择。
(1) 随机引物:随机结合在RNA的任何区域,适用于rRNA、mRNA、tRNA等所有RNA类型的反转录反应。
(2) Oligo (dT):适用于具有PolyA尾的RNA(原核生物RNA、真核生物的rRNA和tRNA不具有PolyA尾)。由于Oligo (dT)结合在PolyA尾上,所以对RNA样品的质量要求较高,即使有少量的降解也会使全长cDNA合成量大大减少。
(3) 基因特异性引物:与模板序列互补,适用于序列已知的基因反转录。
cDNA后续进行PCR扩增长片段,一般用Oligo dT或者基因特异性引物,不建议使用随机引物,因为随机引物是随机结合的,cDNA片段会偏短,增加后续扩增全长目的基因的难度;cDNA后续进行qPCR,一般使用Oligo dT和随机引物的混合物,可以避免3’端和5’端的扩增偏好性。
说明书
NeatScript 1st Strand cDNA Synthesis Kit_manual.pdf (点击下载)